Estreid saab klassifitseerida konkreetse happe alusel, millest need on saadud. Kõige levinumad on karboksüülhappe estrid, mis tekivad karboksüülhappe ja alkoholi reaktsioonil. Näited hõlmavad etüülatsetaadi ja metüülpropionaati. Lisaks neile on anorgaaniliste hapete estrid -nagu sulfaadid ja fosfaadid-, mis leiavad märkimisväärset rakendust tööstus- ja keemiasektoris; näidete hulka kuuluvad dietüülsulfaat ja trifenüülfosfaat. Sõltuvalt kasutatava happe tüübist on saadud estrite omadused, rakendused ja stabiilsus varieeruvad.
Estreid saab klassifitseerida ka nende moodustamisel kasutatud alkoholi tüübi järgi. Kui need moodustuvad küllastunud alkoholidest, annavad nad tavaliselt lihtsaid rasvhappeestreid, nagu triglütseriidid; vastupidi, kui see moodustatakse küllastumata alkoholidest, on tulemuseks küllastumata ester, näiteks glütserüüloleaat. Spetsiaalse struktuuriga alkoholid -nagu tsüklilised alkoholid või aromaatsed alkoholid- võivad samuti reageerida hapetega, moodustades vastavaid tsüklilisi või aromaatseid estreid; seda tüüpi estreid kasutatakse sageli lõhna-, maitse- ja farmaatsiatööstuses.
Struktuuri ja kasutusala põhjal võib estrid laias laastus liigitada lihtsateks, kompleksestriteks ja funktsionaalseteks estriteks. Lihtestrid moodustuvad tavaliselt monokarboksüülhappe reaktsioonil monoalkoholiga ja neid kasutatakse tavaliselt lahustite või lõhnaainetena. Keerulised estrid-nagu triglütseriidid ja fosfolipiidid-moodustavad looduslike lipiidide olulisi komponente. Funktsionaalsed estrid hõlmavad neid, mis sisaldavad spetsiifilisi funktsionaalseid rühmi -nagu polüestrid- ja neid kasutatakse laialdaselt plasti- ja kiutööstuses. Need erinevad klassifikatsioonisüsteemid hõlbustavad estrite omaduste ja erinevate rakenduste sügavamat mõistmist.
